通过QSAR建模和分子动力学研究,研究四种药用植物对登革热病毒的影响
Faisal Alotaibi1, Faris F Aba Alkhayl2, Ahmed I Foudah3
1Department of Pharmacy Practice, College of Pharmacy, Shaqra University, Al-Dawadmi, Saudi Arabia.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|January 10, 2024
概括
这项研究确定了针对登革热病毒 (DENV) NS5甲基转移酶 (MTase) 的潜在植物化学药物候选者. 来自药用植物的化合物显示出有前途的相互作用,表明针对DENV.抗病毒药物开发的新途径.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 药用化学 医学化学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 登革热病毒 (DENV) 是一个重大的全球健康威胁.
- DENV NS5甲基转移酶 (MTase) 对病毒复制至关重要,也是潜在的药物标.
研究的目的:
- 通过虚拟查来识别DENV NS5 MTase的新型植物化学抑制剂.
- 通过分子动力学模拟来评估已识别的化合物的结合亲和力和稳定性.
主要方法:
- 基于机器学习的定量结构-活动关系 (QSAR) 建模.
- 分子对接和重新对接在更高的耗尽性.
- 分子动力学模拟,主要成分分析和自由能源景观分析.
主要成果:
- 在药用植物中发现了四种有前途的植物化学物质 (135398658,5281675,119394,969516).
- 化合物135398658表现出最低的RMSD和最高的键,具有有利的结合自由能量.
- 识别的化合物与催化场残留物 (GLU111,ASP131) 和稳定的复合物形成有直接相互作用.
结论:
- 来自 * Aloe vera * , * Cannabis sativa * , * Ocimum sanctum * 和 * Zingiber officinale * 的植物化学物质显示出作为 DENV NS5 MTase 抑制剂的潜力.
- 这些已识别的化合物需要进一步的实验验证,用于登革热抗病毒疗法.
