分布式多GPUAb Initio密度矩阵重规范化组算法与基酶的P集群的应用
Chunyang Xiang1,2, Weile Jia1,2, Wei-Hai Fang3
1State Key Lab of Processors, Institute of Computing Technology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China.
Journal of chemical theory and computation
|January 10, 2024
概括
我们开发了一种新的分布式多图形处理单元 (GPU) 算法,用于量子化学计算. 这种先进的方法可以进行更大,更准确的复杂过渡金属化合物的模拟,例如铁硫.
科学领域:
- 量子化学 是一个量子化学.
- 计算化学计算化学
- 材料科学 材料科学 材料科学
背景情况:
- 多核过渡金属化合物,如基酶中的铁硫,由于退化的d/f轨道,存在重大计算挑战.
- 现有的量子化学方法与这些系统的复杂性作斗争.
研究的目的:
- 开发一种新的计算方法,准确模拟复杂的过渡金属化合物.
- 克服当前量子化学方法的局限性,用于带有退化的d/f轨道的系统.
主要方法:
- 介绍了第一个分布式多图形处理单元 (GPU) *ab initio*密度矩阵重规范化组 (DMRG) 算法.
- 在现代高性能计算 (HPC) 基础设施上实施.
- 使用运算符并行和批量GPU收缩来并行运算符-波函数乘法.
主要成果:
- 为P星团的活跃空间模型 (在73个活跃轨道中114个电子) 实现了前所未有的键位 (D = 14,000).
- 使用48个NVIDIA A100 80 GB SXM GPU进行计算.
- 与仅使用CPU的计算相比,该系统的DMRG债券尺寸超过了此前的近三倍.
结论:
- 新的分布式多GPUDMRG算法显著提高了复杂系统的量子化学方法的能力.
- 这一进步允许对具有挑战性的多核过渡金属化合物进行更准确,更大规模的模拟.
- 开发的算法适用于现代HPC环境,为未来的发现铺平了道路.
更多相关视频
10:52Multiscale Sampling of a Heterogeneous Water/Metal Catalyst Interface using Density Functional Theory and Force-Field Molecular Dynamics
Published on: April 12, 2019
12.8K
10:27Contrast-Matching Detergent in Small-Angle Neutron Scattering Experiments for Membrane Protein Structural Analysis and Ab Initio Modeling
Published on: October 21, 2018
12.4K
