通过WSInfer和QuPath,为病理学开放和可重复使用的深度学习
Jakub R Kaczmarzyk1, Alan O'Callaghan2, Fiona Inglis2
1Department of Biomedical Informatics, Stony Brook University, Stony Brook, NY, USA. jakub.kaczmarzyk@stonybrookmedicine.edu.
NPJ precision oncology
|January 10, 2024
概括
本研究介绍了WSInfer,这是一个开源软件生态系统,用于在数字病理学中共享和重用深度学习模型. 这促进了对病理学的更广泛研究.
科学领域:
- 计算病理学计算病理学
- 医学中的人工智能
- 生物医学信息学是生物医学信息学.
背景情况:
- 深度学习模型越来越多地用于数字病理学.
- 一个重大挑战是,这些复杂的模型缺乏可重复使用性.
- 这阻碍了人工智能工具在病理学中的更广泛应用和验证.
研究的目的:
- 为数字病理学开发一个开源软件生态系统.
- 促进深度学习模型的共享和重复使用.
- 加速诊断,预后和预测病理学的研究.
主要方法:
- 开发WSInfer,一个开源软件生态系统.
- 专注于简化模型共享和重复使用的过程.
- 实施用于管理和部署深度学习模型的工具.
主要成果:
- WSInfer为数字病理学中的深度学习模型提供了一个集中平台.
- 生态系统简化了模型的可访问性和整合到研究工作流程中.
- 促进合作,减少冗余的发展工作.
结论:
- WSInfer提高了深度学习模型的可访问性和可重复使用性.
- 这使得研究人员能够在数字病理学中提升诊断,预后和预测能力.
- 促进AI驱动的病理学研究的标准化和可重现性.


