TIME-seq减少了用于表观遗传时钟结构的DNA甲基化测量时间和成本
Patrick T Griffin1, Alice E Kane1,2,3, Alexandre Trapp4
1Blavatnik Institute, Department of Genetics, Paul F. Glenn Center for Biology of Aging Research at Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Nature aging
|January 10, 2024
概括
我们开发了TIME-seq,这是一种使用DNA甲基化测量表观遗传时钟的成本效益高的方法. 这种可扩展的技术准确地追踪了老化在多种组织和干预措施在老鼠和人类.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 生物标志物 生物标志物
- 衰老研究研究 衰老研究
背景情况:
- 基于DNA甲基化的表观遗传时钟是关键的衰老生物标志物.
- 对于表观遗传时钟分析的传统方法是昂贵且劳动密集的.
研究的目的:
- 开发一种可扩展,具有成本效益的表观遗传时钟测量方法.
- 通过多种组织和干预来验证新方法.
主要方法:
- 为甲基化测序 (TIME-seq) 开发了基于标记的索引.
- 应用了TIME-seq在八种组织类型的1800多只小鼠DNA样本上.
- 在1,056个个体中使用TIME-seq开发了一个人类血液时钟.
主要成果:
- 时间秒钟是准确的,坚固的,并为特定的监管区域进行了丰富.
- 这种方法比传统方法便宜100倍.
- TIME-seq 时钟有效地反映了诸如饮食变化和小鼠基因治疗等干预措施.
- 开发了一种具有高精度 (R>0.96,中位误差为3.39年) 的经济型人体血液钟.
结论:
- TIME-seq为表观遗传时钟测量提供了一个高度多重化,可扩展和经济的解决方案.
- 这种方法可以在动物模型和人类群体中进行更大规模的表观遗传钟研究.
- TIME-seq使衰老生物标志物的研究和应用更加有效.
