在以色列队列中对目标创始人病原变异检测的诊断收益率和影响

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 医学诊断 医学诊断 医学诊断

背景情况:

• 创始人致病变体 (PVs) 在以色列很常见.
• 目前的做法往往涉及癌症患者的两步遗传测试:最初针对创始人PV进行向测试,然后在负面的情况下进行更广泛的下一代测序.

研究的目的:

• 评估以色列队列中创始人PVs的两步遗传测试方法的诊断产量和实用性.
• 评估癌症患者和具有家族病史的人群中中高透性变体 (MHPV) 和低透性变体 (LPV) 的流行率.

主要方法:

• 对2128名在三级医疗中心接受基因检测的受试者 (2020年3月至2023年1月) 的回顾性分析.
• 测试涉及51个经常出现的创始人PV的小组,不包括已知家族PV的个人 (n=370).
• 分析的重点是MHPV的诊断产量和LPV的检测.

主要成果:

• 在没有已知的家族PV的1758名受试者中,7%携带至少一种变异,4%携带MHPV.
• 创始人MHPV测试的诊断收益率在癌症患者中为2%,在健康人群中具有阳性家族病史的人群中为4%.
• 低透性变体 (LPVs),如APCc.3902T>A,在66%的异构体中发现,主要是亚什肯纳兹犹太人,并且通常与被诊断的癌症无关.

结论:

• 创始人MHPV测试的诊断收益率很低,特别是在癌症患者中.
• 将LPV纳入目标创始变异测试可能会膨胀产量估计,并且可能对癌症诊断没有临床信息.
• 调查结果质疑两步测试策略的效率,并建议重新考虑将LPV纳入初始小组.