在类植物绿化疾病下,类植物根细菌微生物群的同时发生分析

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 类黄龙 (HLB),由 *Candidatus* Liberibacter asiaticus (CLas) 引起,是美国类生产的主要威胁.
• 之前的调查发现,尽管存在HLB压力,但很少有百分比的葡萄树仍然没有CLas.
• 了解与这种无CLas表型相关的微生物因素对于疾病管理至关重要.

研究的目的:

• 在两年时间内调查葡萄树中根系球微生物社区动态.
• 在HLB感染的背景下,确定有助于CLas无现型的微生物因素.
• 探索针对HLB耐药性的潜在的基于微生物的战略.

主要方法:

• 在24个月内从112棵葡萄树中长度取样根DNA.
• 使用Silva 16S数据库v132.2.使用16S rRNA基因元基因组测序.
• 微生物共发生网络分析以确定关键的微生物相互作用和子网络.

主要成果:

• HLB显著降低了树根球微生物群的多样性.
• 行为细菌和蛋白质细菌是占主导地位的细菌群 (>93%),无论HLB状态如何.
• 在健康和晚期HLB树木中发现了一种独特的Streptomycetaceae和促进植物生长的细菌子网络.

结论:

• 根球微生物组的组成随着时间的推移和对HLB感染的反应而发生变化.
• 已识别的与*Streptomycetaceae*相关的子网络可能对HLB起着保护作用.
• 针对这些微生物群落可能为HLB疾病控制提供新的方法.