综合转录学和代谢学分析促进了对Eucommia ulmoidesOliver ulmoidesEucommia ulmoides中的偶然根形成的理解
Qingxin Du1,2, Kangkang Song3,4, Lu Wang1
1State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Non-Timber Forestry, Chinese Academy of Forestry, Zhengzhou 450003, China.
Plants (Basel, Switzerland)
|January 11, 2024
概括
起初较高的素酸 (JA) 水平,然后较低的水平,促进了Eucommia ulmoides中的偶然根 (AR) 形成. 关键的基因和代谢途径,如烯胺生物合成,对于AR的成功发展至关重要.
科学领域:
- 植物生物学 植物生物学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生化学
背景情况:
- 偶然的根 (AR) 形成对于 Eucommia ulmoides 等木质植物的繁殖至关重要.
- 了解AR形成的分子机制对于育种和生产至关重要.
研究的目的:
- 研究影响两个Eucommia ulmoides品种具有不同的AR能力的偶然根 (AR) 形成的分子和代谢因素.
- 为了确定关键的基因,激素和代谢途径参与AR发展.
主要方法:
- 在高和低AR形成的E. ulmoides品种之间对激素水平,转录组和代谢组的比较分析.
- 鉴定枢纽基因,差异表达基因 (DEGs) 和关键代谢物.
- 对cis作用的lncRNA及其调节作用的分析.
主要成果:
- 最佳AR发育与0日高斯酸 (JA) 水平和18日低水平相关.
- 鉴定出了几个枢纽基因 (例如,F-box,SAUR-like,LOB,AP2/ERF,CYP450),这些基因调节了JA交叉通话.
- 烯胺,黄胺和异黄胺生物合成途径在DEGs和代谢物中显著丰富.
- 上调基因 (PAL,CCR,CAD,DFR,HIDH) 和130个cis作用的lncRNA与AR形成有关.
结论:
- 荷尔蒙平衡,特别是JA水平,在E. ulmoides AR形成中起着至关重要的作用.
- 特定的基因和代谢途径是AR发展的关键调节者.
- lncRNAs可能调节参与AR形成的枢纽基因,为植物繁殖提供了新的见解.
