黄金鱼中诺克宁类同类的基因表征:完整的编码序列,结构,系系和组织表达

科学领域:

• 进化生物学 进化生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 夜色素 (noc) 基因参与各种生物过程.
• 了解 noc 类比进化是至关重要的,特别是在全基因组复制事件发生后.
• 金鱼 (一个远) 为研究基因重复和功能分歧提供了一个模型.

研究的目的:

• 为了充分描述所有夜间生物 (noc) 的类比,用金鱼表示.
• 调查骨骨中noc基因的进化起源,包括拼接变体和对应物.
• 建立金鱼类的分类和分类法和并行法.

主要方法:

• 在Osteichthyes的NOC基因演化中的In silico分析.
• 金鱼的全长mRNA测序,以识别异型和拼接变体.
• 预测诺克异型的二级和三级结构.
• 对 noc 基因进行合成分析和遗传树构造.
• 在金鱼和斑马鱼中分析noc对应物的组织表达.

主要成果:

• 在金鱼中发现了noc-a (noc-aa,noc-ab) 的两种同型和noc-b (noc-bb) 的一种同型,每一种都有拼接变体.
• 预测保存的3D结构 (四个α螺旋,九个β片) 对于所有三种 noc 异型.
• 根据合成和遗传学分析,建立了金鱼类的分类和命名体系,并建立了相对应物.
• 在金鱼和斑马鱼中表现出所有 noc 类型的广泛组织表达.
• 在某些组织中观察到特定的夜间对应物的丰富表达.

结论:

• 这项研究提供了一个全面的金鱼的特征和它们的进化历史.
• 保存的蛋白质结构表明noc基因的功能重要性.
• 不同的组织表达模式表明,在teleosts中,有潜在的新或亚功能性 noc 对应物.