通过多目标对接,MM\GBSA,QM-DFT和多尺度模拟,确定了3-1-BenCarMethInYlPro-Phosphonic酸对肺癌的适当活性
Mohammed Ageeli Hakami1, Ali Hazazi2, Fawaz Albloui2
1Department of Clinical Laboratory Sciences, College of Applied Medical Sciences, Shaqra University, Al-Quwayiyah 19257, Saudi Arabia.
International journal of molecular sciences
|January 11, 2024
概括
这项研究确定了一种有前途的多向药物候选药物,即[3-(1-基-3-基甲基-2-甲基-1h--5-基) -基-]酸 (DB02504),用于肺癌治疗. 计算分析证实了其在克服药物耐药性和抑制瘤生长方面的潜力.
科学领域:
- 计算机化药物发现.
- 分子建模分子建模
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 肺癌具有复杂的分子形状和有限的治疗选择,往往需要创新的治疗策略.
- 单向药物由于疾病异质性而表现出有限的疗效,突出显示了需要多向方法的需要.
- 多目标药物设计可以通过同时抑制多个与癌症相关的蛋白质和途径来提高疗效并克服耐药性.
研究的目的:
- 通过分子对接和模拟来确定肺癌的新型多目标候选药物.
- 评估潜在药物化合物对关键肺癌蛋白质的疗效.
- 评估有前途的候选药物的药理动力学特性和稳定性.
主要方法:
- 使用HTVS,SP和XP算法对肺癌标进行了分子对接研究:BIP/GRP78 ATPase,myosin 9B RhoGAP,EYA2酸酶,RSK4激酶和CRMP-1.
- 药物银行化合物被选,有前途的候选人被使用MM\GBSA.过.
- 为了评估药物稳定性和相互作用,进行了药理动力学,基于QM的DFT和100 ns的MD模拟.
主要成果:
- [3-(1-基-3-碳甲基-2-甲基-1h-醇-5-氧) -基-]酸 (DB02504) 被确定为一种强大的多目标药物候选物.
- 对接和MM/GBSA得分分别在5.83~10.66和7.56~50.14Kcal/mol之间.
- MD模拟显示稳定的性能 (<2 Å偏差),表明与标蛋白的显著相互作用,其中IE,GLY,VAL,TYR,LEU和GLN是关键残留物.
结论:
- DB02504显示出作为肺癌多目标候选药物的巨大潜力,显示出有希望的计算结果.
- 该化合物与多个标相互作用的能力表明,有办法克服耐药性并抑制瘤的进展.
- 需要进一步的实验验证,以确认DB02504在肺癌治疗中的疗效.
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