一个全面的,基于废水的流行病学开源数据模型
Jean-David Therrien1, Mathew Thomson2, Eugen-Sorin Sion3
1modelEAU, Université Laval, Québec City, QC G1V 0A6, Canada
基于废水的流行病学 (WBE) 监测人口健康. 公共卫生环境监测开放数据模型 (PHES-ODM) 标准化环境监测数据,以获得更好的公共卫生洞察力.
科学领域:
- 环境科学环境科学
- 公共卫生 公共卫生
- 数据科学是数据科学.
背景情况:
- SARS-COV-2 流行病加速了基于废水的流行病学 (WBE) 用于人口健康监测的使用.
- 环境监测数据需要上下文,以便在不同地点进行有意义的解释.
- 开放的数据共享对于科学进步和公共服务至关重要.
研究的目的:
- 引入公共卫生环境监测开放数据模型 (PHES-ODM) 的第二次代.
- 加强环境监测数据的互操作性和上下文化.
- 为公共卫生监测提供开源工具,用于数据收集,管理和分析.
主要方法:
- 开发了PHES-ODM,一个开源数据模型和工具.
- 该模型标准化了环境监测计划数据的存储,包括样本元数据和测量协议.
- 软件工具支持数据收集,PCR计算,验证和SQL数据库生成.
主要成果:
- 在PHES-ODM方便存储的上下文元数据与环境监测数据一起.
- 它为数据处理提供工具,包括PCR计算和验证.
- 该模型支持生成分析准备的数据集和数据库模式.
结论:
- PHES-ODM提供了一种标准化的方法,用于创建可靠,可互操作和开放的环境公共卫生数据集.
- 它适用于SARS-CoV-2监测和其他公共卫生监测计划.
- 开源模型在国际上得到了采用,促进了协作环境健康监测.
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