通过计算机生物信息学通过Polygonum cuspidatum对COVID-19干预的分子机制进行初步研究

科学领域:

• 草药是一种草药.
• 网络药理学 网络药理学
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 新型冠状病毒疾病2019 (COVID-19) 构成了全球重大健康挑战.
• 传统中医 (TCM) 提供了潜在的治疗途径.
• 多角 (Polygonum cuspidatum) 是一种具有已知的药用功能的草药.

研究的目的:

• 使用网络药理学研究COVID-19中Polygonum cuspidatum的作用机制.
• 识别与COVID-19相关的Polygonum cuspidatum中的活性化合物及其标.
• 阐明涉及治疗效果的关键分子通路.

主要方法:

• 网络药理学方法集成TCM数据库和生物信息学工具.
• 来自Polygonum cuspidatum的活性成分和标的识别.
• 使用像GENECARDS这样的数据库对COVID-19目标的分析.
• 蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建和通路丰富分析 (基因和基因组的京都百科全书).
• 分子对接模拟和核心化合物聚达丁体内验证.

主要成果:

• 从Polygonum cuspidatum中确定了9个活性成分和286个目标,其中27个目标与COVID-19重叠.
• NF-kappaB (NF-κB) 信号通路被确定为干预的关键通路.
• 聚达丁没有表现出细胞毒性,但在体外抑制了NF-κB转录活性.
• 分子对接证实了聚达丁和关键蛋白质 (IL-1β,TNF,ICAM-1) 之间的稳定相互作用.

结论:

• 多边形树 (Polygonum cuspidatum) 对抗COVID-19具有多组分,多目标和多途径的影响.
• NF-kappaB信号通路是Polygonum cuspidatum在COVID-19中的作用的关键目标.
• 聚达丁是一种关键活性化合物,为进一步的研究和药物开发提供了基础.