进化分析主要基因相容性复合体变体的基抗性和敏感两动物的进化分析
1School of Biological Sciences, College of Natural Sciences, Seoul National University, Seoul 08826, Republic of Korea; Research Institute of Basic Sciences, Seoul National University, Seoul 08826, Republic of Korea.
概括
两类MHC IIß1进化显示了重组和积极选择,特别是在与抗菌 (Batrachochytrium dendrobatidis) 相关联的部位. 这些发现揭示了对抗这种新兴传染病的进化机制.
科学领域:
- 进化生物学是进化的生物学.
- 免疫遗传学 免疫遗传学
- 两动物疾病生态学
背景情况:
- 由Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) 引起的cytridiomycosis是全球两动物减少的主要驱动因素.
- 主体主要基因相容性复合体 (MHC) 基因具有高度多态性,对免疫反应至关重要,MHC类II与Bd耐药性有关.
研究的目的:
- 调查亚洲Bd耐药性 (Bufo gargarizans) 和澳大利亚Bd敏感性 (Litoria caerulea) 的anuran物种MHC IIß1等位基因中的重组和选择模式.
- 了解两类MHC IIß1适应状虫感染的进化基础.
主要方法:
- 来自B. gargarizans和L. caerulea. 的功能性MHC IIß1等位基因的比较分析.
- 在MHC IIß1序列上进行了重组和选择试验 (dN/dS比).
- 积极选择的氨基酸位点的识别和物理化学性质 (疏水性) 的分析.
主要成果:
- 在两种物种中检测到同一地点的重组,支持其在MHC IIß1多样性中的作用.
- 在两种物种的MHC IIß1等位基因中都发现了积极选择.
- 在Bd敏感的L. caerulea中,在阳性选择下,特定的氨基酸位在Bd耐药的B. gargarizans中被保留或被消极选择,这表明它在Bd耐药性中发挥了作用. 这些地点的疏水性可能是关键因素.
结论:
- 重组和积极选择是影响两生物MHC IIß1多样性和功能的关键进化力量.
- 在MHC IIß1中的特定氨基酸替代和物理化学特性可能会对Batrachochytrium dendrobatidis产生抗性.
- 这些发现为了解两动物对新出现的传染病的免疫反应提供了进化框架.
