路径活动推断方法对基因表达数据的稳定性评估

Tay Xin Hui1, Shahreen Kasim2, Izzatdin Abdul Aziz3

  • 1Soft Computing and Data Mining Center, Faculty of Computer Sciences and Information Technology, Universiti Tun Hussein Onn Malaysia (UTHM), 83000, Batu Pahat, Malaysia.

BMC bioinformatics
|January 12, 2024
PubMed
概括

途径活动推断方法在六个癌症数据集的稳定性方面进行了评估. 基于的定向随机步行 (e-DRW) 显示出优异的可重现性,而基于路径拓学的 (PTB) 方法在识别癌症标志物方面通常优于非拓学的 (非TB) 方法.