在奶酪皮皮微生物组中的Penicillium物种的基因组,转录组和生态多样性
Ruby Ye1, Megan Biango-Daniels1, Jacob L Steenwyk2
1Department of Biology, Tufts University, Medford, MA, USA.
Fungal genetics and biology : FG & B
|January 13, 2024
概括
奶酪皮皮尼西菌在细菌群体上表现出不同的影响. 它们对二次新陈代谢的基因组潜力有所不同,影响相互作用,并突出了这种真菌属内的生态多样性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 虫菌对农业,工业和生物医学系统产生重大影响.
- 在各种微生物组中,Penicillium物种的生态作用尚不清楚.
研究的目的:
- 研究奶酪皮皮的二次新陈代谢的基因组潜力.
- 确定Penicillium对细菌社区聚集的影响.
- 阐明Penicillium-细菌相互作用的机制.
主要方法:
- 使用了35种从奶酪皮皮中分离出来的Penicillium菌株.
- 用于生物合成基因集群识别的antiSMASH.
- 在共同培养中测量了细菌丰富度和真菌mRNA表达.
主要成果:
- 确定了1558个生物合成基因集群,其中406个与已知的途径 (毒素,抗微生物药物) 相关.
- 观察到Penicillium菌株对细菌生长和社区组成的不同影响.
- 在对细菌的反应中,在Penicillium中发现了有限的差异性基因表达,与一些共同的营养物代谢途径的上调.
结论:
- 与奶酪相关的Penicillium物种在塑造细菌群落的能力方面表现出显著的差异.
- 在Penicillium属内的生态多样性是相当大的.
- 对多个物种群体的真菌反应在测试的菌株中没有得到保护.
