基于免疫细胞透和构建风险预测模型的预后,对膀癌进行分类
Guicao Yin1, Shengqi Zheng2, Wei Zhang2
1Department of Urology, the Affiliated Hospital of Yangzhou University, Yangzhou 225000, Jiangsu Province, China. 1613094489@qq.com.
概括
膀癌患者可以根据免疫细胞透得分进行分类,识别可能受益于免疫疗法和化疗的群体. 一种新的风险评分模型和名图准确预测膀癌患者的预后.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 膀癌的预后是复杂的,需要改进的预测工具.
- 免疫细胞透在瘤行为和治疗反应中起着关键作用.
研究的目的:
- 在免疫细胞透的基础上对膀癌患者进行分类.
- 用关键的免疫相关基因开发膀癌的预后模型.
主要方法:
- 利用了癌症基因组图谱 (TCGA) 转录组和临床数据.
- 使用单个样本基因组丰富分析计算了免疫细胞透得分.
- 采用无监督聚类,加权基因相关性网络分析 (WGCNA) 和 LASSO 考克斯回归.
主要成果:
- 在膀癌中确定了关键的免疫细胞 (B细胞,巨细胞,中性粒细胞,T辅助细胞,瘤透淋巴细胞).
- 将患者分为两组,对免疫疗法和化疗有不同的反应.
- 开发了一个4基因 (GPR171,HOXB3,HOXB5,HOXB6) 风险评分模型和一个具有高预测精度的1,3年和5年生存率的名图.
结论:
- 免疫细胞透得分有效地对膀癌患者进行分类.
- 开发的风险评分模型和名图准确预测膀癌患者的预后.
