对比的转录基因分析显示,在非转移的低级别形瘤中,表皮质-介质细胞过渡程序的激活

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 结肠直肠癌 (CRC) 转移涉及表皮细胞-介质细胞过渡 (EMT),血管生成和细胞外矩阵 (ECM) 相互作用.
• 与CRC相比,尾的低级粘膜性瘤 (LAMN) 和低级膜瘤 (lgPMP) 的转移潜力有限.

研究的目的:

• 为了比较LAMN,lgPMP和CRC的分子概况和途径分析,以了解转移性差异.
• 确定影响这些尾和结直肠瘤转移行为的关键分子区别.

主要方法:

• 在LAMN,lgPMP和CRC病例上使用Poly(A) RNA测序进行转录组分析.
• 生物信息和统计分析包括差异性基因表达,聚类,主要成分分析和基因组丰富分析.

主要成果:

• 一个28基因签名区分了LAMN,lgPMP和CRC.
• 在EMT,ECM相互作用和血管生成途径的调节方面存在差异.
• 意想不到的是,EMT基因组与LAMN和CRC相比,在lgPMP中显著丰富,EMT标记物的表达发生变化 (Vimentin,TWIST1,N-Cadherin,E-Cadherin).
• 与EMT和转移相关的MMP1和MMP3水平在CRC中高于lgPMP.

结论:

• 瘤生物行为和中肠恶性瘤中的转移模式与不同的基因表达特征相关.
• 在非转移的lgPMP中观察到强烈的EMT程序激活,挑战了EMT和血液传播之间的直接联系.
• 进一步的途径分析对于理解转移机制和开发向治疗至关重要.