基因组范围内的内部和跨特定可转移的SSR标记的开发,以及构建一个动态的网络资源,用于子分子育种:Y2MD

科学领域:

• 遗传学 遗传学 是一个
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 植物育种 植物育种

背景情况:

• 微卫星标记物对于种群遗传学和繁殖至关重要.
• 亚姆在经济上具有重要意义,但缺乏全面的微卫星标记资源.
• 现有的资源不足以进行先进的山羊遗传研究.

研究的目的:

• 在四种亚姆物种中进行全基因组微卫星标记器开发.
• 为了识别跨物种可转移的标记物.
• 为研究人员建立一个专门的,用户友好的网络门户.

主要方法:

• 在 Dioscorea alata,D. rotundata,D. dumetorum 和 D. zingiberensis 中对微卫星进行全基因组选.
• 为已识别的微卫星设计初始器对.
• 跨物种可转移标记物的识别和实验验证.
• 开发Yam微卫星标记器数据库 (Y2MD).

主要成果:

• 在四种亚姆物种中发现了数百万个微卫星.
• 设计了864,128对的原料.
• 识别了1170个跨物种可转移的微卫星标记物,其中17/18个经过实验验证.
• 部署 Y2MD 数据库与集成的生物信息学工具.

结论:

• 这项研究提供了首个全面的微观卫星标记资源,用于多种山姆物种.
• 开发的标记物和Y2MD数据库将大大推进山羊遗传研究和标记物辅助育种.
• Y2MD为全球研究人员提供了一个有价值的,可访问的平台.