针对新出现的猪病原体Mycoplasma hyosynoviae的多部位序列类型化方案
Moritz Bünger1, Michael Blümlinger1, Igor Loncaric2
1University of Veterinary Medicine Vienna, University Clinic for Swine, Veterinärplatz 1, 1210 Vienna, Austria.
Veterinary microbiology
|January 18, 2024
概括
猪病原体Mycoplasma hyosynoviae的新类型化方法揭示了高菌株多样性. 核心基因组 (cg) MLST和常规MLST都对流行病学研究有效,cgMLST为密切相关的分离物提供更高分辨率.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 菌菌 (M. hyosynoviae) 是一种猪病原体,引起关节炎.
- 对M.hyosynoviae的流行病学研究受到缺乏有效的类型化方法的限制.
研究的目的:
- 开发和比较传统的多部位序列类型 (MLST) 和核心基因组 (cg) MLST方案,用于M.hyosynoviae.
- 评估M. hyosynoviae菌株的遗传多样性和流行病学相关性.
主要方法:
- 开发使用全基因组序列的390个点基因cgMLST方案.
- 为传统的MLST选择七个家庭基因.
- 使用cgMLST和常规MLST,对73种M. hyosynoviae菌株进行类型化.
主要成果:
- cgMLST在M.hyosynoviae菌株中发现了高度的遗传多样性.
- 确定了7个克隆群,包括20个单独物种.
- 这两种方法都产生了一致的家族遗传树,cgMLST显示了略高的分辨率.
结论:
- 无论是cgMLST还是传统的MLST都适合用于M. hyosynoviae的流行病学分析.
- cgMLST提供了增强的分辨率,用于区分密切相关的隔离物.
- 这些方法将有助于对M. hyosynoviae的科学和诊断调查.
