2D和3D体外血管生成试验突出了血管生成的不同方面
Julian Rapp1, Jan Ness2, Julian Wolf1
1Eye Center, Medical Center - University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg, Germany.
Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
|January 20, 2024
概括
与二维模型相比,三维 (3D) 血管生成试验揭示了内皮细胞中更全面的分子变化. 这些3D模型更好地反映了体内癌症血管生成,特别是关于细胞矩阵相互作用和糖解.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 选择适当的体外模型对于精确的血管生成研究至关重要.
- 2D和3D血管生成试验之间的差异以及它们与体内数据的相关性尚未完全理解.
研究的目的:
- 为了研究二维和三维血管生成试验之间的分子差异.
- 通过转录组分析,将这些体外模型与癌症相关血管生成的体内数据进行比较.
主要方法:
- 人类静脉内皮细胞在2D (伤口愈合,增殖) 和3D (球状芽) 试验中用VEGF治疗.
- 大量RNA测序评估了VEGF诱导的转录基因转移;免疫细胞化学证实了蛋白质表达.
- 转录组数据与来自癌症组织的单细胞RNA测序数据相关.
主要成果:
- 在3D (767个基因) 和2D (167个基因) 环境中,VEGF诱导了更多样化的转录基因转移.
- 3D测试显示了细胞矩阵相互作用,尖端细胞形成和糖解中的明显的VEGF诱导的变化.
- 在体内,癌症血管内皮细胞表现出与3D设置相似的转录组形状,特别是在细胞矩阵相互作用和糖解中.
结论:
- 与二维测试相比,三维血管生成试验可能为研究与癌症相关的血管生成提供更相关的模型.
- 这些发现强调了测试选择对研究准确性的重要性.
- 3D分析更好地捕捉了血管生成的关键方面,包括与癌症相关的细胞矩阵相互作用和糖解.
