在胰腺癌中,PRKCSH作为一种潜在的免疫和预后生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 蛋白激酶C基质80K-H (PRKCSH) 参与N端糖化和瘤发生.
• 它在各种癌症类型中的作用需要全面调查.

研究的目的:

• 对PRKCSH表达,预后价值和临床相关性进行泛癌分析.
• 探索PRKCSH与瘤突变负担,微卫星不稳定性,瘤免疫力和治疗点的关联.

主要方法:

• 利用TCGA,GTEx和CCLE数据集进行PRKCSH的泛癌分析.
• 评估的mRNA/蛋白质表达,生存,临床特征,TMB,MSI,免疫透,基因变异,甲基化和药物敏感性.
• 进行了GSEA和单细胞分析.

主要成果:

• 在大多数瘤中,PRKCSH过度表达,与六种癌症类型的整体存活率差相关.
• 在11种瘤类型中,随着疾病的晚期,PRKCSH的表达增加.
• 在PRKCSH和TMB,MSI和免疫细胞群体之间发现了显著的相关性.
• PRKCSH的遗传变异表明了有利的无疾病生存率.
• PRKCSH甲基化与其表达具有负相关性,并且与正常组织相比,在十种瘤类型中减少.
• 在Cmap分析中,发现了24种潜在的治疗性小分子.

结论:

• PRKCSH作为一种潜在的瘤基因和一个有前途的预后标志物.
• 在各种恶性瘤中,PRKCSH可以作为免疫治疗的治疗标.