一个系统的屏幕,用于在真菌王国中选择可转移的元素

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 进化生物学 进化生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 新型蛋白质功能对于分子进化至关重要,基因重复,重组和水平获取作为关键机制.
• 可转移元素 (TE) 越来越多地被认为是新型蛋白质编码序列的重要来源,但它们对蛋白质组进化的影响还未得到充分研究.

研究的目的:

• 调查菌蛋白质组内TE衍生域的流行率和进化意义.
• 确定对蛋白质新性有贡献的特定TE家族,并分析它们的基因分布.

主要方法:

• 对1237个真菌基因组进行分析,以确定含有TE衍生域的蛋白质.
• 遗传学分析以确定TE衍生域的起源和保留模式.
• 详细调查涉及转录沉默的特定宿主-TE融合.

主要成果:

• 在真菌王国中检测到超过13,000个具有潜在TE衍生域的预测蛋白质.
• 在5多个基因组中发现了825个TE衍生域,表明长期的进化持久性.
• 来自Academ,Kolobok和Helitron的化酶域是最常见的TE衍生域.
• 在Saccharomycotina中观察到更高的TE选择率,在这些基因组中提供了一个新的蛋白质多样性的来源.
• 确定了一种具有异色色转录沉默功能的候选宿主-TE融合,可能调节TE和基因表达.

结论:

• 通过宿主-TE融合,TE是真菌中蛋白质新奇性的重要,整个王国的来源.
• 该研究提供了TE对真菌蛋白质进化的贡献的全面视图,促进了对融合蛋白的进一步研究.