开发一种基于单个核酸多态的菌株鉴定方法,用于Streptococcus thermophilus CICC 6038和Lactobacillus delbrueckii ssp. 布尔加里克斯CICC 6047使用泛基因组学分析

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 食品科学 食品科学 食品科学

背景情况:

• 益生菌的健康益处是菌株特定的,需要精确的识别方法.
• 热杆菌CICC 6038和乳杆菌delbrueckii ssp. 这两种类型. 布尔加里克斯 (Bulgaricus CICC 6047) 是一个商业价值的益生菌菌株.
• 现有的方法缺乏特异性,敏感性和效率来区分这些菌株.

研究的目的:

• 开发一种特定的,敏感的,准确的,快速的,方便的和具有成本效益的方法来区分S. thermophilus CICC 6038和L. delbrueckii ssp. 布尔加里克斯 (Bulgaricus) CICC 6047.7. 这种植物是
• 通过泛基因组分析识别特定物种的核心基因和特定菌株的SNP.
• 验证基于PCR的方法用于菌株级益生菌的鉴定.

主要方法:

• 对S. thermophilus和L. delbrueckii ssp.的泛基因组分析 保加利亚人 (Bulgaricus).
• 鉴定特定物种的核心基因和特定菌株的单核酸多态 (SNP).
• 开发和验证针对独特的SNP进行定性识别的PCR原料.

主要成果:

• 针对S. thermophilus CICC 6038和L. delbrueckii ssp.的特定菌株SNP被确定. 布尔加里克斯 (Bulgaricus) CICC 6047.7. 这种植物是
• 基于这些SNP设计的PCR原料准确地区分了目标菌株与其他菌株.
• 测序证实了序列长度和独特SNP的一致性,使得可靠的识别成为可能.

结论:

• 基于SNP的菌株特定PCR方法可以准确和可重复地区分S. thermophilus CICC 6038和L. delbrueckii ssp. 布尔加里克斯 (Bulgaricus) CICC 6047.7. 这种植物是
• 这种方法在菌株层面对益生菌识别具有普遍适用性.
• 开发的方法适用于商业乳制品的质量控制和合规性评估.