使用机器学习开发和验证一种病理学模型,以预测头癌中CXCL8表达和预后
Weihua Wang1, Suyu Ruan1, Yuhang Xie1
1Department of Otolaryngology-Head and Neck Surgery, Shanghai East Hospital, School of Medicine, Tongji University, Shanghai, China.
Clinical and experimental otorhinolaryngology
|January 21, 2024
概括
使用CXCL8mRNA表达的新病理学模型有效地预测了头部和部状细胞癌 (HNSCC) 患者的预后. 高CXCL8水平与生存率下降相关,提供潜在的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 无线电学 (Radiomics) 是一种无线电学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 需要针对个性化医学的新型预后生物标志物.
- 病理学,一个定量成像分析,正在成为一个关键的工具.
- 炎症性细胞因子CXCL8与患者的存活率有关.
研究的目的:
- 调查CXCL8mRNA表达和HNSCC.病理特征之间的关系.
- 开发一种病理学模型,用于预测HNSCC患者的预后.
- 探索CXCL8在HNSCC中的作用背后的生物机制.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) -HNSCC数据集用于mRNA测序和临床数据.
- 使用卡普兰-梅尔曲线进行生存分析,以将CXCL8表达与整体生存 (OS) 相关联.
- 从H&E染色图像中提取病理特征,应用mRMR-RFE和后勤回归用于模型开发.
主要成果:
- 高CXCL8mRNA表达与HNSCC患者的OS降低显著相关.
- 一个逻辑回归病理学模型,使用16个放射学特征,展示了强大的预测性能.
- 该模型显示了预测和观察到的高基因表达概率之间的良好一致性,表明了临床适用性.
结论:
- 基于CXCL8mRNA表达的病理学模型是HNSCC预后和临床决策的可行工具.
- 升高的CXCL8可能与减少DNA损伤和促炎性瘤微环境有关.
- 对于HNSCC治疗,CXCL8是一个潜在的治疗点.
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