菲克提巴西勒斯 (Fictibacillus fluitans sp.) 是一种有毒的植物. Nov.,从淡水池中分离出来的
Amit Yadav1, Akanksha Maurya2, Yash Bhavsar3
1National Centre for Microbial Resource, National Centre for Cell Science, Ganeshkhind, Pune, 411007, India. amityadav@nccs.res.in.
Archives of microbiology
|January 22, 2024
概括
一种新的有氧细菌Fictibacillus fluitans NE201^T在印度的淡水池中被发现. 这种形成子的细菌表现出独特的代谢能力,使其成为Fictibacillus属中的新物种.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 细菌的分类学 细菌的分类学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 从印度的淡水环境中分离出一种新型的阳性,有氧性,子形成细菌,菌株NE201^T.
- 最初的表征揭示了不同的生理和生化特性.
研究的目的:
- 为了对NE201^T.菌株进行全面的分类学表征.
- 为了确定NE201^T菌株是否代表Fictibacillus属内的新物种.
主要方法:
- 生理和生化测试,包括生长条件 (温度,pH,NaCl耐受性).
- 使用16S rRNA基因序列和全基因组数据 (92个核心基因,20个蛋白质) 的家族遗传学分析.
- 数字DNA-DNA杂交 (dDDH) 和正方形ANI计算.
- 脂肪酸和极性脂质分析.
- 用antiSMASH对生物合成基因集群进行基因组分析.
主要成果:
- 菌株NE201^T在30°C,pH7.0和0%NaCl的条件下表现出最佳的生长.
- 16S rRNA基因序列与Fictibacillus enclensis NIO-1003^T的相似性为99.01%.
- dDDH (33.7%) 和orthoANI (87.68%) 的值表明它是一个不同的物种.
- 遗传学分析证实其位于Fictibacillus属内.
- 发现了独特的碳利用模式和多种生物合成基因集群 (烯,NRPS,兰氏).
- 主要的脂肪酸:前异异-C15:0 (51.42%) 和异异-C15:0 (18.88%). 主要的极性脂质:PG,PE,DPG.
结论:
- 现型,基因型和化学分类学数据强烈支持将NE201^T菌株归类为新物种.
- 这个名字是Fictibacillus fluitans sp. 对于这种新物种,提出了Nov.
- 类型菌株是NE201^T (=MCC 5285 = JCM 36474) 的.
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