在人类淋巴细胞细胞系AHH-1中选辐射差异表达的圆形RNA并建立剂量分类模型
Xue-Lei Tian1, Ting-Ting Zhang1, Tian-Jing Cai1
1Chinese Center for Disease Control and Prevention, China CDC Key Laboratory of Radiological Protection and Nuclear Emergency, National Institute for Radiological Protection, Beijing, PR China.
International journal of radiation biology
|January 22, 2024
概括
循环RNAs (circRNAs) 在暴露于辐射后显示出快速生物对称性的潜力. 这些分子可以准确地分类辐射剂量,有助于放射性事故期间的医疗反应.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 辐射生物学 辐射生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 快速和高通量生物对称对于放射性事故后的医疗资源分配至关重要.
- 目前的生物测量方法缺乏必要的速度和吞吐量.
- 已知电离辐射会改变人体细胞和组织中的循环RNA (circRNA) 表达.
研究的目的:
- 调查circRNAs对于早期辐射剂量分类的适用性.
- 为了确定对辐射有反应的circRNAs,用于生物测量应用.
主要方法:
- 转录组测序和生物信息学分析被用来识别AHH-1细胞辐射后的差异表达的circRNA.
- 用实时PCR和线性回归在多个时间点 (4,24,48小时) 分析了剂量反应关系.
- 通过接受器操作特征 (ROC) 曲线分析开发和验证了六个circRNA面板.
主要成果:
- 确定并验证了11种辐射差异表达的circRNAs.
- 循环RNA面板在区分暴露与非暴露个体方面表现出高准确性 (AUC=1000).
- 循环RNA面板也有效地分类了不同的辐射剂量组 (AUC=0.963-1.000).
结论:
- 电离辐射显著调节人体淋巴状细胞中的circRNA表达特征.
- 差异表达的circRNAs显示出开发快速和高通量生物测量仪的希望.
- 经过验证的circRNA面板为辐射剂量分类提供了一种敏感和特定的方法.
