在Nellore肉牛中,针对不同小牛的稳定性进行全基因组关联研究
Diogo Osmar Silva1, Gerardo Alves Fernandes Júnior2, Larissa Fernanda Simielli Fonseca2
1Animal Science Department, School of Agricultural and Veterinary Sciences, São Paulo State University (Unesp), Jaboticabal, SP, Brazil. diogoosmarsilva@gmail.com.
BMC genomics
|January 23, 2024
概括
在生命的早期选择牛以保持稳定,特别是第二次分娩时,可以加速遗传进步. 这种方法侧重于生殖和免疫系统遗传学,不同于以后的生活选择,强调整体动物健康.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 量化遗传学 量化遗传学
- 基因组选择 基因组选择
背景情况:
- 稳定性是群体长寿的衡量标准,通常在牛生命的晚期进行评估.
- 晚期生命评估增加了代际间隔,可能会减缓每年的遗传收益.
- 早期生命稳定性评估需要了解其在各种生产阶段的遗传结构.
研究的目的:
- 为了确定影响Nellore牛的稳定性的基因组区域,跨越不同的分娩数量.
- 为了探索涉及到牛整个生产寿命的稳定性遗传途径.
- 在育种计划中评估早期生命稳定性选择的可行性.
主要方法:
- 全基因组关联研究 (GWAS) 确定SNP稳定性的重要窗口.
- 通过顶部SNP窗口解释的添加基因变异的分析.
- 在重要的基因组区域内对基因的功能注释和通路分析.
主要成果:
- 顶部SNP窗口解释了稳定性的大量遗传变异 (13.70%-21%).
- 在17个染色体上确定了重要的区域,其中包含176个注释基因.
- 生命早期的稳定性 (第2-6个分娩) 与生殖,神经和免疫系统基因有关;晚年 (7-8个分娩) 与动物的一般健康 (骨密度,癌症) 有关.
结论:
- 早期生命稳定性选择的基因组区域不同于后期生命选择的基因组区域.
- 生命早期的选择 (第2-6个分娩) 涉及生殖和免疫因素;生命后期的选择强调一般健康.
- 在较早的年龄选择稳定性,例如第二次分娩,可以显著缩短代际间隔,并加速育种计划中的遗传进步.
