全基因组DNA甲基化和癌前胃心脏病变的转录组模式
Xiaoqi Liao1, Runhua Lin1,2, Zhihua Zhang1
1Department of Pathology, Shantou University Medical College, Shantou, People's Republic of China.
Journal of the National Cancer Institute
|January 23, 2024
概括
胃心脏癌前病变 (PGCLs) 显示出从肠道转化 (IM) 到内皮质瘤 (IEN) 的分子变化越来越多. OLFM4是胃心脏风险分层的潜在生物标志物 IM.
科学领域:
- 胃肠病学 胃肠病学
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 肠道形 (IM) 和内皮瘤 (IEN) 是胃心脏癌 (GCC) 的前体.
- 了解癌前胃心脏病变 (PGCLs) 对早期检测和预防至关重要.
- 对IM的风险分层要求确定可靠的生物标志物.
研究的目的:
- 为了研究PGCLs的组织病理和分子概况.
- 为了确定胃心脏风险分层的生物标志物IM.
- 为了比较IM和IEN中的分子变化.
主要方法:
- 在中国高发病率和非高发病率的海湾合作委员会地区对4578名参与者的医院评估.
- 在PGCL组织中分析850K甲基化阵列 (n=42) 和RNA-seq (n=44).
- 候选生物标志物蛋白质表达的免疫组织化学检查.
主要成果:
- 来自高发病率地区的个人患PGCL的患病率更高 (26.7%对13.5%).
- 从IM类型I,II到III的DNA甲基化和基因表达改变的逐步增加,在IEN达到顶峰.
- 类型III IM和IEN共享了具有异常促进子甲基化的三个差异表达基因 (DEG),OLFM4在IEN表达增加 (P<.001).
结论:
- 第三类IM和IEN在胃心脏中具有相似的表观遗传和转录特征.
- OLFM4是胃心脏IM风险预测的潜在生物标志物.
- 这些发现有助于预癌性胃病变的风险分层.
