LT和SOX9表达与区分默克尔细胞多细胞瘤病毒 (MCPyV) 阳性和默克尔细胞多细胞瘤癌 (MCPyV) 阴性的基因组相关

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学是一种遗传学.

背景情况:

• 默克尔细胞癌 (MCC) 是一种具有两种主要亚型的侵袭性神经内分泌瘤:默克尔细胞多瘤病毒 (MCPyV) 阳性和紫外线辐射 (UVR) 相关.
• 阳性MCPyVMCC具有较低的突变率,并且与紫外线无关,而阴性MCPyVMCC通常发生在阳光照射区域,并可能与状细胞癌共存.
• 病毒瘤蛋白,大T抗原 (LT) 和小T抗原 (sT),在MCC中驱动着不同的致癌途径.

研究的目的:

• 在MCPyV阳性与MCPyV阴性MCC中识别不同表达的基因.
• 描述MCC两种亚型中的突变负担和关键突变基因.
• 确定与MCC患者存活率相关的临床和分子因素.

主要方法:

• 在92个MCC患者样本上使用nCounter技术对172个基因的基因表达概况.
• 用GATK最佳实践对26个基因进行突变分析,以识别体质单核酸变体 (SNVs).
• 多变量生存分析以确定预后因素.

主要成果:

• 与LT阳性MCC相比,LT阴性MCC (n=37) 显示出与上皮分化 (SOX9) 和细胞循环 (MYC,CDK6) 相关的基因的差异表达,与LT阳性MCC相比 (n=55).
• LT阳性MCC的平均SNV频率为4.3,而LT阴性MCC的平均SNV频率为10 (P=0.03).
• SNAI1和CDK6表达被确定为患者存活的独立风险因素.

结论:

• 具有弱LT表达的MCC瘤表现出与状分化和细胞周期相关的基因表达模式,以及更高的突变负担.
• 这些发现支持MCPyV阳性和MCPyV阴性MCC亚型的独特分子和病因概况.
• 基因表达和突变状态是MCC行为和患者预后的关键决定因素.