对于非破坏性3D病理学的端到端工作流
Kevin W Bishop1,2, Lindsey A Erion Barner1, Qinghua Han1,2
1Department of Mechanical Engineering, University of Washington, Seattle, WA, USA.
Nature protocols
|January 24, 2024
概括
这项研究提供了一个详细的3D病理学工作流程,用于高质量的组织成像. 该协议使用光H&E染色和光片显微镜,使研究能够进行全面的体积分析.
科学领域:
- 病理学和实验室医学的医学.
- 生物医学成像技术 生物医学成像技术
- 历史学 历史学 历史学
背景情况:
- 传统的二维病理学方法在组织成像体积和上下文信息方面存在局限性.
- 三维 (3D) 病理学提供了增强的组织可视化,没有破坏性切割.
- 生成一致的,高质量的3D病理学数据集需要对整个工作流进行细致的优化.
研究的目的:
- 为3D病理学工作流提供详细,端到端的协议.
- 为临床前和临床研究提供高质量的3D病理学数据集的持续生成.
- 为各种各样的最终用户提供指南,包括生物学家,临床研究人员和工程师.
主要方法:
- 开发和描述一个全面的3D病理学工作流程.
- 利用光片显微镜作为一个说明性成像平台.
- 专注于一种光类型的血素和乙素 (H&E) 染色,以与黄金标准的病理报告相兼容.
主要成果:
- 介绍了一个端到端的3D病理学程序,涵盖组织准备,成像和初始数据处理.
- 该方案是详细的,足以进行控制良好的临床前和临床研究.
- 工作流需要3-6天才能完成,不包括数据分析时间.
结论:
- 提供的协议有助于生成高质量的3D病理学数据集.
- 这种工作流提高了体积组织分析能力,超出了传统的2D方法.
- 该指南支持在研究和临床环境中更广泛地采用3D病理学.


