通过超深度自适应性免疫受体谱系测序捕捉到cynomolgus的多层次广泛多样性
Yan Zhu1,2,3,4, Haipei Tang1,3, Wenxi Xie4
1Center for Precision Medicine, Medical Research Institute, Guangdong Provincial People's Hospital (Guangdong Academy of Medical Sciences), Southern Medical University, Guangzhou 510080, China.
Science advances
|January 24, 2024
概括
适应性免疫受体谱 (AIRRs) 在组织内和组织之间显示出广泛的异质性. 这项研究确定了新的等位基因,并揭示了影响V基因使用的因素,为适应性免疫网络提供了洞察力.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 适应性免疫受体谱 (AIRRs) 对于免疫反应至关重要.
- 了解AIRR在组织内和组织间的多样性和分布是必不可少的,但仍然具有挑战性.
研究的目的:
- 调查个人内部和个人之间的AIRR异质性.
- 识别新的免疫受体等位基因,并分析影响它们使用的因素.
- 探索肠道组织中的适应性免疫网络和共享的免疫反应.
主要方法:
- 超深层次的测序22和25个组织,来自三只.
- 识别和确认新的IGHV和TRBV等位基因.
- 对V基因使用模式的分析,考虑遗传学,同型,组织群和组织.
主要成果:
- 确定了84个新的IGHV和114个新的TRBV等位基因,确认率很高.
- 由遗传学,同型,组织群和组织所影响的异质V基因使用.
- 在肠道组织中观察到更高比例的共享克隆,这表明肠内适应性免疫网络.
- 在公共和共享的IgM/IgD克隆中发现显著更高的突变负担,表明共享抗原的潜在向.
结论:
- 在多个层面上,AIRR表现出广泛的异质性.
- 遗传学,同型和组织微环境显著影响AIRR组成.
- 肠道组织拥有独特的适应性免疫网络.
- 共享的适应性免疫反应可能会准常见的抗原.
- 生成的数据可以作为未来免疫学研究的宝贵资源.
