四方组代谢物质参考材料用于实验室间的能力测试和代谢学分析的数据整合
Naixin Zhang1, Qiaochu Chen1, Peipei Zhang1
1State Key Laboratory of Genetic Engineering, School of Life Sciences and Human Phenome Institute, Shanghai Cancer Center, Fudan University, Shanghai, China.
Genome biology
|January 24, 2024
概括
本研究引入了代谢物参考材料,以改善代谢学数据的可比性. 基于比率的分析使得准确的跨实验室数据集成可用于可靠的研究.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 基因组学就是基因组学.
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 实验室开发的代谢学方法在实验室间的可比性方面存在重大挑战.
- 由于实验协议和数据处理的变化,整合各种代谢数据集是很困难的.
- 缺乏标准化的参考材料阻碍了代谢学研究的可靠性.
研究的目的:
- 为四方项目建立一套代谢物参考材料.
- 评估不同实验室的代谢学数据的可靠性和可比性.
- 开发一种有效整合多样化的代谢数据集的方法.
主要方法:
- 从B型淋巴细胞细胞系中建立四种代谢物参考材料.
- 使用有针对性和非有针对性的策略生成全面的液态染色体质谱学 (LC-MS) 代谢数据.
- 基于比率的代谢学概况的应用,用于跨实验室的定量数据整合.
主要成果:
- 在各实验室中发现了代谢组分分析可靠性的显著差异.
- 基于比例的代谢学概况使得准确的跨实验室定量数据集成成为可能.
- 为了进行实验室间准确性评估,构建了高可靠性参考数据集.
结论:
- 该研究提供了宝贵的资源和实验室间熟练测试的最佳实践.
- 开发的方法确保了大规模和纵向代谢学研究的可靠性.
- 标准化的参考材料和数据整合策略对于推动代谢学研究至关重要.


