通过基于结构的查和分子动力学模拟来确定向GSTe2的强抑制剂
KumChol Kim1,2, Wenjing Zhang1, Peng Chen1
1Jiangsu Key Laboratory for Biodiversity and Biotechnology, College of Life Sciences, Nanjing Normal University, Nanjing, China.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|January 25, 2024
概括
研究人员确定了两个新型化合物,ZINC000169293362和ZINC000095566957,作为Tribolium castaneum epsilon谷氨S转移酶 (TcGSTe2) 的潜在抑制剂. 这些化合物显示出降低抗虫剂耐药性和控制红面粉虫种群的前景.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 计算化学的计算化学
- 虫害管理 虫害管理 虫害管理
背景情况:
- 红色面粉甲虫 (Tribolium castaneum) 对储存的农产品和人类健康产生重大影响.
- 昆虫epsilon谷氨S转移酶 (GSTs) 对抗虫剂耐药性和昆虫变形至关重要.
- TcGSTe2是害虫控制策略的潜在目标.
研究的目的:
- 使用in silico方法识别TcGSTe2的新型抑制剂.
- 评估这些抑制剂在害虫控制和降低抗虫剂耐药性的潜力.
主要方法:
- 从ZINC数据库中对3618种类似GSH的化合物进行分子建模和对接.
- 用于毒性预测的ADMET测定.
- 分子动力学 (MD) 模拟,主要成分分析和MM / PBSA分析用于结合亲和力和稳定性评估.
主要成果:
- 确定ZINC000169293362和ZINC000095566957是具有高结合亲和力和没有预测毒性的潜在TcGSTe2抑制剂.
- 与参考GSH相比,MD模拟表明TcGSTe2-ZINC000169293362复合物的稳定性更高.
- 对TcGSTe2-ZINC000169293362和TcGSTe2-ZINC000095566957的计算结合自由能量明显低于对TcGSTe2-GSH的计算.
结论:
- 已识别的化合物ZINC000169293362和ZINC000095566957是TcGSTe2抑制的有希望的候选物.
- 这项研究为开发策略提供了新的见解,以减少害虫对杀虫剂的抗性.
- 这些发现可以指导针对昆虫GST的新型抑制剂的设计,以有效管理害虫.
