通过加权基因共同表达网络分析,构建EndMT相关动脉样硬化的竞争性内源性RNA网络

科学领域:

• 心血管生物学 心血管生物学
• 分子医学是分子医学.
• 系统生物学 系统生物学

背景情况:

• 动脉样硬化是一种慢性炎症性疾病,涉及内皮功能障碍和斑块积累.
• 内皮转介质过渡 (EndMT) 有助于动脉样硬化,但其调节机制尚未完全理解.
• 竞争的内源性RNA (ceRNA) 网络与动脉样硬化病因产生有关.

研究的目的:

• 在动脉样硬化中构建和分析EndMT相关的ceRNA网络.
• 研究丹-申- (DSY) 在动脉样硬化中的潜在治疗机制.
• 为了确定关键的调节基因和途径参与EndMT在动脉样硬化进展期间.

主要方法:

• 来自GEO数据库的综合基因表达特征.
• 应用加权基因共同表达网络分析 (WGCNA) 来构建ceRNA网络.
• 进行了功能丰富分析,ROC曲线分析,卡普兰-梅尔分析和分子对接.

主要成果:

• 构建的EndMT相关的ceRNA网络主要参与炎症反应.
• 网络中的枢纽基因有效地区分正常血管和动脉样硬化病变.
• 高IL1B表达预测了动脉样硬化患者的缺血事件.
• DSY的生物活性成分对关键的EndMT相关 lncRNAs (例如,AC003092.1,MIR181A1HG) 具有潜在的结合亲和力.

结论:

• 与EndMT相关的ceRNA网络在动脉样硬化病变发生过程中发挥着重要作用.
• 通过调节已识别的ceRNA网络并减轻EndMT,DSY可能对动脉样硬化产生治疗作用.
• 确定了关键的ncRNA和枢纽基因,代表了动脉样硬化的潜在治疗标.