在韩国生物银行网络中为病理记录开发文本提取和标准化系统
SooJeong Ko1,2, Sunghyeon Park1,2, SeolWhan Oh1
1Department of Medical Informatics, College of Medicine, The Catholic University of Korea.
Studies in health technology and informatics
|January 25, 2024
概括
这项研究开发了一种高效的,逐步的数据提取系统,用于从韩国生物银行网络 (KBN) 的病理记录. 该系统在处理肺癌和乳腺癌队列时实现了91%的准确性,改善了研究数据的可访问性.
科学领域:
- 生物医学信息学 生物医学信息学
- 癌症研究 癌症研究
- 这是生物银行.
背景情况:
- 韩国生物银行网络 (KBN) 管理着对研究至关重要的有价值的病理记录.
- 从这些记录中提取有效和准确的数据对于推动科学发现至关重要.
- 当前的数据提取方法可能耗时且容易出现错误.
研究的目的:
- 建立一个节省时间和减少错误的系统,从KBN病理记录中提取数据.
- 用现实世界癌症队列数据验证系统的性能.
- 促进跨多个机构的更广泛的数据利用.
主要方法:
- 开发一个系统的,逐步的数据提取协议.
- 实施质量控制措施以尽量减少错误.
- 在大批肺癌 (769) 和乳腺癌 (1292) 患者身上测试该系统.
主要成果:
- 开发的系统在时间效率和错误减少方面取得了显著的改善.
- 在提取过程中,获得了91%的整体精度.
- 在多种癌症队列上成功验证表明系统的稳定性.
结论:
- 已建立的数据提取系统为处理KBN病理记录提供了可靠和高效的解决方案.
- 这一进步可以通过改善对高质量的生物库数据的访问来加速研究.
- 该系统有可能在其他管理类似数据集的机构中应用.
