微生物TCM:微生物群和中国传统医学的相互作用的综合平台
Yufeng Chen1, Yu Shi1, Chengbang Liang1
1School of Traditional Chinese Medicine, School of Life Science, School of Acupuncture-Moxibustion and Tuina, Beijing University of Chinese medicine, Beijing 100029, China.
Pharmacological research
|January 25, 2024
概括
本研究介绍了MicrobeTCM,这是一个全面的数据库,将传统中医 (TCM) 和肠道微生物联系起来. 它通过整合数据和预测疾病的治疗机制来促进TCM研究.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 传统中国医药 传统中国医药
背景情况:
- 生物信息学的进步使得针对微生物的疗法成为可能.
- 传统中医 (TCM) 和肠道微生物的数据库独立存在.
- 缺乏连接TCM和肠道微生物组的统一数据库.
研究的目的:
- 为TCM开发最全面的微生态数据库.
- 通过弥合传统医学和微观生态系统之间的差距,加速TCM研究.
- 标准化TCM和微生物相关研究的数据检索和集成.
主要方法:
- 标准化的文献检索策略识别了PubMed和六个数据库中的419篇文章.
- 高质量的数据集成使用双输入提取来最大限度地减少自然语言处理的不确定性.
- 通过药物和标实体相似性以及已知的药物标关联来预测作用机制.
主要成果:
- 微生物TCM数据库包括171种疾病,725种微生物,1468种草药配方,1032种草药,15780种化学成分,35种针点配方和77种针点.
- 建立了一个可重复的文献检索和数据集成过程.
- 相似性策略有助于预测新的TCM干预措施的影响.
结论:
- MicrobeTCM是第一个整合TCM和肠道微生物的全面数据库.
- 该平台通过提供标准化数据和预测能力来支持TCM研究.
- 它可以通过利用现有的TCM和微生物数据来预测疾病的治疗机制.
