正常粘膜中的DNA甲基化变异性:在患有腺瘤多的患者中,一种野外癌症标志物

科学领域:

• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 结肠直肠癌研究研究
• 基因组医学是基因组医学.

背景情况:

• 现场癌变描述了正常细胞变得易患癌症.
• 评估结肠中的这一过程有助于预测和预防结肠直肠癌风险.

研究的目的:

• 在患有腺瘤多体 (AP) 的个体中检测现场癌症.
• 评估DNA甲基化变异及其作为癌症早期检测和风险分层的生物标志物的潜力.

主要方法:

• 从瑞士表观遗传结直肠癌研究 (SWEPIC) 中分析了1111名参与者的DNA甲基化和84名参与者的RNA测序.
• 对分辨能力,基因组定位,临床相关性和RNA表达模式的评估甲基化变异.
• 在外部队列中验证的结果.

主要成果:

• 鉴定了558个独特的DNA位点,在与APs相邻的正常头部组织中具有失调的甲基化.
• 开发了一个使用腺瘤相关的差异变量和甲基化CpG (aDVMCs) 的分类器,该分类器区分了健康与AP相邻组织 (ROC AUC = 0.63-0.81) 并在外部集中验证 (ROC AUC = 0.82-0.88).
• 发现aDVMC失调与多多重性和年龄相关,并且在活性基因组区域中富含相关的改变基因表达.

结论:

• 现场癌症在瘤转变期间在右结肠的早期开始.
• aDVMC失调与腺瘤的出现有关,可以作为加强监测的分层工具.