使用甲醇固定和冷保存对急性髓性白血病细胞单细胞转录组分析

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学
• 血液学 血液学 血液学

背景情况:

• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 提供了对细胞机制的深入了解.
• 在临床环境中,为scRNA-seq获得可行的细胞可能具有挑战性.
• 甲醇固定为常规临床应用提供了潜在的解决方案.

研究的目的:

• 评估甲醇固定作为DMSO冷保存的替代方案,用于scRNA-seq.
• 评估长期甲醇固定对人类原发性白血病细胞的影响.
• 为了确定甲醇固定用于临床使用的可行性.

主要方法:

• 两个急性髓性白血病 (AML) 样本被固定在甲醇中12-18个月.
• 再加水的甲醇固定细胞和DMSO冷保存的细胞接受了scRNA-seq.
• 在固定和冷保存方法之间比较了转录资料.

主要成果:

• 甲醇固定,即使在一年多之后,也产生了与DMSO冷保存对scRNA-seq.的结果相似的结果.
• 初步数据表明,由于甲醇固定,一些转录和遗传修饰.
• 在存储超过一年的甲醇固定样本中观察到遗传降解.

结论:

• 短期甲醇固定适用于白血病爆发样本,与DMSO冷保存有相似之处.
• 甲醇固定提供了一个更简单的方法来将scRNA-seq整合到常规的临床实践中.
• 延长甲醇固定超过一年可能会损害遗传完整性.