基因多样性和Colletotrichum sublineola病变型的分类使用一套标准的 Sorghum 差异
Louis K Prom1, Ezekiel Jin Sung Ahn2, Ramasamy Perumal3
1Crop Germplasm Research Unit, USDA-ARS, 2881 F & B Road, College Station, TX 77845, USA.
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
|January 26, 2024
概括
对Colletotrichum sublineola的遗传分析显示,在人类病原体种群中存在显著的多样性. 这项研究发现了新的病变型和耐药的种系,这对于控制这种破坏性叶病至关重要.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 由Colletotrichum sublineola引起的炭病是一种主要的病,导致显著的收获损失.
- 病原体的遗传变异性使疾病管理策略复杂化.
- 识别耐药的 Sorghum 品种对于作物保护至关重要.
研究的目的:
- 为了研究科莱托里奇姆 (Colletotrichum sublineola) 的基因多样性和种群结构.
- 为了确定病原性和识别新型病变型的anthracnose病原体.
- 为了识别具有稳定抗抗炭毒的种.
主要方法:
- 使用限制位点相关测序 (RAD-Seq) 测序140个Collettotrichum亚线性分离物,生成1244个单核酸多态 (SNP).
- 种群结构和集群分析以确定基于孤立起源的遗传关系和多样性.
- 病毒性测定使用30个隔离物在18个区分线上进行,以识别病变型.
主要成果:
- SNP数据显示,分离物种的基因多样性低至高,基于地理来源 (格鲁吉亚,北卡罗来纳州,德克萨斯州,波多黎各) 形成了独特的集群模式.
- 种群结构分析确定了病原体内的八个不同的种群和一个混合组.
- 病毒性分析确定了27种新的病型,其中特定的种 (SC748-5,SC112-14,Brandes) 呈现耐药性,其他 (BTx623,TAM428) 呈现易感性.
结论:
- 这项研究强调了Colletotrichum sublineola复杂的遗传景观,需要地理上知情的管理方法.
- 鉴定到的 Sorghum 差异性和新病态型为全球性特征化 Anthracnose 的基础.
- 开发具有持久耐药性的种需要了解病原体的多样性,并利用已识别的耐药来源.
关键词:
科莱托里希姆 (Colletotrichum) 亚线 (sublineola) 是一种植物.遗传变异性 遗传变异性病原性是一种病原性.病态型 病态型 病态型红糖 (Sorghum anthracnose) 是一种有毒的植物.
