根据ORF0多样性,美国哨兵棉花地块棉花叶卷矮人病毒和全球可用的参考隔离物之间的遗传变异性
Raphael O Adegbola1, Nathaniel D Ponvert1, Judith K Brown1
1School of Plant Sciences, University of Arizona, Tucson, AZ 85721.
Plant disease
|January 26, 2024
概括
棉花叶卷矮人病毒 (CLRDV) 在美国和南美洲显示出显著的遗传多样性. 分析揭示了多次引入和明显的美国入侵焦点,影响了棉花生产.
科学领域:
- 植物病毒学 植物病毒学
- 分子进化的分子进化.
- 农业昆虫学 农业昆虫学
背景情况:
- 棉花叶纸矮病毒 (CLRDV) 是一种由虫传播的聚类病毒,对棉花生产构成重大威胁.
- 最初在南美洲被发现,CLRDV已经在美国商业棉花种植场上出现,需要了解其遗传多样性和传播.
研究的目的:
- 在美国和南美洲研究棉花叶卷矮人病毒 (CLRDV) 的物种内部多样性.
- 确定美国CLRDV种群的起源和传播模式.
主要方法:
- 对CLRDV的高度分歧的ORF0/P0编码区域进行比较序列分析.
- 来自美国和参考种群的ORF0序列的贝叶斯系遗传学分析和主要成分分析 (PCA).
主要成果:
- 确定了三种不同的群体 (一个美国,两个南美) 和七种统计支持的物种群体.
- 在美国和南美CLRDV分离物中观察到广泛的遗传多样性.
- 至少有两个主要的美国入侵焦点在阿拉巴马-乔治亚州和德克萨斯州东部被确定,前者与广泛扩张有关.
结论:
- CLRDV表现出显著的物种内部多样性,有证据表明多次引入到美国.
- 阿拉巴马 - 乔治亚州的创始人人口负责该病毒最近在美国东南部和中部地区的广泛传播.
- 灾难性的天气事件可能通过分散受感染的棉花虫来促进CLRDV的引入和传播.


