工业微生物的基因组规模代谢网络模型代谢工程:目前的进展和未来的前景
Zhijin Gong1, Jiayao Chen1, Xinyu Jiao1
1National Energy R&D Center for Biorefinery, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China; Beijing Key Laboratory of Bioprocess, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China.
Biotechnology advances
|January 27, 2024
概括
基因组规模的代谢网络模型 (GSMs) 对于设计微生物细胞工厂 (MCFs) 至关重要. 本综述详细介绍了GSM的发展和在代谢工程中的应用,以改善生物制造.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 代谢工程是代谢工程.
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 高性能微生物细胞工厂 (MCF) 对于生物制造至关重要,但由于复杂的微生物代谢网络而面临挑战.
- 基因组规模的代谢网络模型 (GSMs) 提供了in silico模拟功能,以指导MCF的设计和建造.
研究的目的:
- 审查16个工业微生物GSM的发展状况.
- 概述促进高质量的GSM建设的技术.
- 总结GSM在指导代谢工程中的应用.
主要方法:
- 对16种工业微生物GSM进行了审查.
- 对GSM重建技术的分析:数据库,空白填补,基于约束的建模,算法和可视化工具.
- 在代谢工程中GSM应用的总结:特征探索,遗传扰乱预测,表型优化和细胞工厂建设.
主要成果:
- 该审查涵盖了GSM重建技术的进展.
- 强调了GSM在代谢工程中的关键应用,包括预测代谢行为和指导实验设计.
- 该研究提供了关于GSMs当前状态和未来方向的全面概述.
结论:
- GSM是理解和设计微生物代谢的强大工具.
- 随着GSM和相关技术的持续发展,将加速为生物制造提供高效的MCF的建设.
- 本综述是重建GSM并将其应用于代谢工程的参考.
