探索感染SARS-CoV-2的儿童鼻微生物群的特征
L Romani1, F Del Chierico2, S Pane3
1Infectious Disease Unit, Bambino Gesù Children's Hospital, IRCCS, Rome, Italy.
Microbiology spectrum
|January 30, 2024
概括
儿童COVID-19患者表现出明显的鼻 (NP) 微生物群概况,有益细菌减少,病原生物增加. 这些微生物标记在感染初期就存在,并在整个疾病过程中保持一致.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 病毒学 病毒学
- 儿科 儿科 儿科
背景情况:
- COVID-19对成年鼻 (NP) 微生物群的影响已被记录.
- 有限的研究存在于儿科COVID-19及其与NP微生物群的关联.
- 儿童通常表现出较轻微的COVID-19症状,这表明潜在的保护因素,如NP微生物组.
研究的目的:
- 为了调查COVID-19诊断的儿童的NP微生物群组成.
- 将儿科COVID-19患者的NP微生物群与健康对照组进行比较.
- 为了确定与儿科COVID-19感染相关的特定微生物特征.
主要方法:
- 从儿科COVID-19患者和健康对照组中收集了NP抽样.
- 在NP微生物群分析中使用了16S rRNA向元基因组学.
- 使用QIIME 2.0,PICRUSt 2和机器学习模型进行数据分析和分类.
主要成果:
- 与对照组相比,COVID-19患者在NP微生物群中的α多样性减少.
- 在COVID-19患者中, Streptococcus,Haemophilus和Staphylococcus等特定的细菌种群被丰富.
- 像Faecalibacterium,Akkermansia和Bifidobacterium这样的有益细菌在COVID-19患者中减少了.
- 机器学习确定了Enterococcus,Pseudomonas和Streptococcus作为儿童COVID-19的关键NP微生物群生物标志物.
- 随着时间的推移,没有观察到NP微生物群的显著变化或与病毒载量相关.
结论:
- 儿科COVID-19与一个独特的NP微生物群概况有关,其特点是病原生物丰富和有益的初生的减少.
- 特定的微生物特征在感染开始时就显而易见,并在整个疾病中持续存在.
- 在儿童中,NP微生物群可能在COVID-19的独特疾病表现中发挥作用.
