在废水中对肝炎E病毒的监测可以识别出临床相关的变异
Fiona Rau1, Carina Elsner2, Toni Luise Meister1,3,4,5
1Medical Faculty, Department for Molecular and Medical Virology, Ruhr University Bochum, Bochum, Germany.
概括
肝炎E病毒 (HEV) 已广泛传播,并且可能出现耐药变种. 废水和河流的环境监测揭示了高HEV流行率,并确定了这些临床相关的变体.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 环境科学 环境科学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 在全球范围内,E型肝炎病毒 (HEV) 导致持续性感染和严重疾病.
- 抗病毒治疗可以选择具有逃生突变的HEV变体,从而阻碍病毒清除.
- 关于HEV变种在人类群体和环境中的流行率和多样性的数据有限.
研究的目的:
- 在环境样本 (废水和河流) 中调查HEV的流行率和遗传多样性,在德国北莱-威斯特伐利亚州.
- 识别循环的HEV变种,包括与耐药性相关的变种.
主要方法:
- 环境样本 (废水,河流) 从德国北莱-威斯特伐利亚州收集.
- 使用定量逆转录PCR (qRT-PCR) 来检测HEVRNA.
- 使用高通量测序来评估遗传多样性和识别变异.
主要成果:
- 在73%的环境样本中检测到HEVRNA.
- 高通量测序揭示了检测到的HEV菌株中显著的遗传多样性.
- 确定了临床相关的HEV变种,可能与耐药性相关.
结论:
- 环境监测,特别是废水和河流的环境监测,是估计HEV流行率的宝贵工具.
- 这种方法可以识别循环的HEV变异,包括那些影响治疗结果的变异.
- 了解环境中的HEV多样性对于管理持续性感染和治疗策略至关重要.
