对英国监狱废水流行病学SARS-CoV-2定量化基因标和采样制度的比较
Kelly Jobling1, Marcos Quintela-Baluja1, Francis Hassard2
1School of Engineering, Newcastle University, Newcastle upon Tyne NE1 7RU, UK; The authors contributed equally to the manuscript.
Journal of water and health
|January 31, 2024
概括
基于废水的流行病学 (WBE) 有效地跟踪了监狱中的SARS-CoV-2,与COVID-19病例相关. 在WBE中使用两个基因标可以减少假阴性,提高监狱健康监测.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 公共卫生 公共卫生
- 传染病监测 传染病监测 传染病监测 传染病监测
背景情况:
- 监狱是传染病传播的高风险环境,由于接近密切.
- 社交距离等非药物干预措施在惩戒设施中效果较差.
- 替代监测方法对于监狱中的病原体检测至关重要.
研究的目的:
- 评估基于废水的流行病学 (WBE) 以量化监狱废水中的SARS-CoV-2流行情况.
- 确定WBE作为监狱健康保护系统的一部分的实用性.
- 评估WBE数据与惩戒设施内的COVID-19病例数量之间的相关性.
主要方法:
- 在12周内,分析了来自英国六所监狱的266个废水样本.
- 使用定量逆转录酶-聚合酶连锁反应 (RT-qPCR) 向N1和E基因检测SARS-CoV-2.
- 14小时和2小时复合采样方法和人口规范化技术的比较.
主要成果:
- 在废水中使用N1和E基因测试检测到SARS-CoV-2片段.
- 这两种基因标都与报告的COVID-19病例数 (p < 0.01) 有显著的相关性.
- 使用N1和E基因减少了假阴性结果,因为在25%的阳性样本中错过了一个目标.
结论:
- 基于废水的流行病学 (WBE) 在监狱环境中对监测传染病 (包括SARS-CoV-2) 显著有前途.
- 建议在WBE中使用双基因标 (N1和E),以提高检测准确度.
- WBE可以在惩戒设施的综合健康保护战略中作为一个有价值的工具.
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