结构,生化和生物信息的基础,以识别激进的SAM环烯合成酶
Yi Lien1, Jake C Lachowicz2, Aigera Mendauletova1
1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Denver, Denver, Colorado 80210, United States.
研究人员确定了新型环基 (CP) 合成酶,这对于在核糖体合成和翻译后修改的 (RiPPs) 中形成环基 (CPG) 是至关重要的. 一个晶体结构揭示了一种独特的铁酸结合,这对于酶活性至关重要.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 分子生物学分子生物学
- 酶学 是一种酶学.
背景情况:
- 激进的S-adenosyl-l-methionine (RS) 酶,特别是RS-SPASM亚家族,对于修改来说至关重要.
- 环烯支架在制药开发中很重要,需要对其合成有更深入的了解.
研究的目的:
- 为了定义循环 (CP) 合成酶的家族.
- 描述一种新型的CP合成酶,TigE及其相关的RiPP通路.
- 阐明CP合成酶活动的结构和机制基础.
主要方法:
- 使用RadicalSAM.org.org进行CP合成酶的生物信息扩展.
- 识别和描述TigB前体和TigE酶.
- 液体染色学-质谱学 (LC-MS) 和核磁共振 (NMR) 分析.
- 提格的X射线晶体学.
主要成果:
- 发现了一种新的RiPP途径,涉及具有重复TIGSVS动机的TigB.
- 表明TigE可以催化TigB中的异黄素形成甲基-cyclopropylglycine (甲基-CPG).
- 蒂格的晶体结构揭示了一个独特的甘氨酸-氨酸-氨酸动机,使氨酸结合到 [4Fe-4S] 集群中,这对活动至关重要.
结论:
- 这项研究定义了CP合成酶家族,并描述了一位新成员TigE.
- 一种独特的机制,涉及到对辅助集群的铁酸结合,对于CP合成酶的功能至关重要.
- 这些发现为含有环的的生物合成提供了洞察力.
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