在EVI1+3q - 骨髓性白血病细胞中与EVI1表达相关的促剂中心色素相互作用
Han Leng Ng1, Mark E Robinson1,2, Philippa C May1
1Department of Immunology and Inflammation, Faculty of Medicine, Centre for Haematology, Imperial College London, London, UK.
骨髓性白血病中的EVI1表达,与3q变化无关,是由促进体相互作用驱动的,而不是增强体. 这一发现澄清了特定白血病亚型中EVI1基因调节的机制.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- EVI1表达与髓性白血病的预后不佳相关.
- 染色体变化 (Chr.3q) 可以通过增强剂并置和长距离染色体相互作用来驱动EVI1表达.
- 在没有3q变异的情况下,驱动EVI1表达的机制以前尚不清楚.
研究的目的:
- 研究具有Chr.3q变异 (EVI1+3q-) 的髓性白血病细胞中EVI1表达的机制.
- 确定EVI1+3q-细胞中的EVI1表达是否是由异常增强体激活或其他调节元件驱动的.
- 阐明CTCF/凝聚素和长距离相互作用在EVI1+3q-白血病中的EVI1调节中的作用.
主要方法:
- 染色体构造捕获技术用于分析长距离染色体相互作用.
- 克里斯普尔干扰 (克里斯普尔i) 用于基因沉默.
- 基因表达分析 (RNA测序) 来评估转录相关性.
- 对CTCF/凝聚性依赖性的分析.
主要成果:
- 在EVI1+3q-骨髓性白血病细胞中,EVI1促进体与其他活性基因的促进体相互作用,而不是增强体.
- 在EVI+3q-细胞中,EVI1表达和远程相互作用与CTCF/cohesin无关.
- 一个促进子近位点增强了EVI1表达在EVI1+3q-细胞中,也参与了3q+细胞中CTCF介导的循环.
- 长距离相互作用将EVI1与多个基因促进体联系起来,具有相关的转录.
- 特定部位的沉默最小限度地降低了EVI1的表达.
结论:
- 在3q-骨髓性白血病中,EVI1的表达主要由促进体驱动,可能涉及长距离促进体聚类.
- 在3q-白血病中发现了EVI1表达的新特征.
- 这些发现表明,EVI1和EVI1+3q-白血病中的其他基因之间存在共享的转录调节机制.
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