作为肝肝细胞癌的预后和诊断指标的G6PD和机器学习算法
Fei Li1, Boshen Wang1,2, Hao Li1
1Key Laboratory of Environmental Medicine Engineering of Ministry of Education, School of Public Health, Southeast University, 87 Dingjiaqiao, Nanjing, 210009, Jiangsu, China.
BMC cancer
|January 31, 2024
概括
葡萄糖-6-酸脱酶 (G6PD) 在肝肝细胞癌 (LIHC) 中显著上调,有助于癌症进展. G6PD和决策树C5.0对LIHC的早期检测和治疗充满希望.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物化学 生物化学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 肝肝细胞癌 (LIHC) 是一个重大的全球健康挑战,死亡率高.
- 驱动LIHC发展的精确病原机制尚未完全阐明.
研究的目的:
- 调查葡萄糖-6-酸脱酶 (G6PD) 在LIHC病变发生中的作用.
- 评估G6PD作为LIHC的潜在诊断和预后生物标志物.
主要方法:
- 利用TCGA,ICGC和GEO数据库的生物信息学分析来研究差异性基因表达.
- 使用Nomogram和机器学习算法 (Adaboost,Catboost,GbdT,决策树C5.0) 进行预测预测.
- 进行了细胞实验,以评估G6PD淘汰对肝细胞癌细胞行为的影响.
主要成果:
- 与正常肝脏组织相比,LIHC组织中的G6PD表达显著增加.
- 确定G6PD是LIHC发展的一个实质性贡献因素,Nomogram和回归分析显示了显著的百分比.
- 通过G6PD敲击抑制了肝细胞癌细胞的增殖,迁移和入侵.
- 在评估的机器学习模型中,决策树C5.0在预测LIHC患者预后方面表现优越.
结论:
- 升高的G6PD表达与LIHC进展有关,可以作为诊断标记物.
- G6PD和决策树C5.0的组合为早期LIHC检测和治疗策略开发提供了一种新的方法.
