识别重要的微生物生物标志物用于结肠癌的诊断,使用随机森林方法
Lichao Cao1, Shangqing Wei1, Zongyi Yin2
1School of Life Sciences, Northwest University, 710127, Xi'an, Shaanxi Province, China.
Heliyon
|February 1, 2024
概括
研究人员确定了两种与结肠癌诊断相关的特定微生物. 这一发现为临床实践中早期检测和个性化治疗策略提供了潜在的新生物标志物.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 结肠癌是一种普遍存在的恶性瘤,复发率和转移率很高.
- 微生物群落在癌症发展和进展中的作用是一个新兴的研究领域.
- 有限的研究已经调查了特定微生物和结肠癌瘤之间的直接关联.
研究的目的:
- 识别与结肠癌诊断和预测相关的致病微生物.
- 评估已识别的微生物标记物的诊断和预测性能.
- 为改善结肠癌查和个性化治疗建立新的分子标记.
主要方法:
- 来自67名结肠癌患者的组织和血液样本的分析.
- 利用下一代测序来进行微生物识别.
- 采用随机森林算法用于诊断预测模型的构建.
主要成果:
- 建立了一个包含13,187种致病微生物的综合数据库.
- 两种特定的致病微生物, *Synthetic.construct*_32630和 *Dicrocoelium.dendriticum*_57078,被确定与结肠癌有关.
- 开发的诊断预测模型在瘤组织和血液样本中表现出强的性能.
结论:
- 这项研究提供了第一个特定致病微生物作为结肠癌诊断分子标记物的证据.
- 这些发现为提高结肠癌查效率提供了潜在的新途径.
- 鉴定的标记物可能有助于开发针对结肠癌患者的个性化治疗方法.
