IBR工具:用于计算综合生物标志物索引的R包
Anna Carolina Resende1, Diego Mauro Carneiro Pereira2
1Marine Ecology and Ecosystem Modelling Lab, School of Biological Sciences Victoria University of Wellington Wellington New Zealand.
Ecology and evolution
|February 2, 2024
概括
该R包IBRtools简化了计算综合生物标志物响应 (IBR) 和IBRv2索引. 这种工具有助于有效地使用多种生物标志物数据评估环境退化.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 统计建模 统计建模
背景情况:
- 多种生物标志物研究对于早期检测环境退化至关重要.
- 综合生物标志物反应 (IBR) 和IBRv2是评估生物标志物反应的关键指数.
- 现有的方法对于全面的生物标志物分析可能是复杂的.
研究的目的:
- 介绍R包IBR工具用于计算IBR和IBRv2索引.
- 为标准化生物标志物数据分析提供一个用户友好的工具.
- 通过多种生物标志物促进对环境退化的评估.
主要方法:
- 该IBR工具包实现了IBR和IBRv2计算的算法.
- 包括用于索引标准化和雷达图表创建的功能.
- 提供实践应用的示例数据集和工作流.
主要成果:
- 该IBR工具包可以同时计算IBR和IBRv2.
- 提供标准化的索引值和可视化工具.
- 展示了小型和大型数据集的易用性.
结论:
- IBRtools提供了一种简化的方法来分析R.R.中的多生物标志物数据.
- 提高环境退化评估的可访问性和效率.
- 使研究人员能够有效地利用IBR和IBRv2进行生态监测.


