来自接受体外膜氧化治疗的新生儿的支气管洗液中的病原体识别的下一代元基因组测序
Yi-Rong Zheng1, Xiu-Hua Chen, Qiang Chen
1From the Department of Cardiac Surgery, College of Clinical Medicine for Obstetrics & Gynecology and Pediatrics, Fujian Medical University, Fujian Children's Hospital (Fujian Branch of Shanghai Children's Medical Center), Fuzhou, China.
The Pediatric infectious disease journal
|February 2, 2024
概括
与传统测试相比,超基因组下一代测序 (mNGS) 在体外膜氧化 (ECMO) 上提供了更敏感和更早的新生儿病原体检测. 这种方法有助于优化新生儿肺炎的抗生素治疗.
科学领域:
- 新生儿医学 新生儿医学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 基因组医学是基因组医学.
背景情况:
- 接受体外膜氧化 (ECMO) 的新生儿面临感染的高风险.
- 迅速和精确的病原体鉴定对于改善这些脆弱患者的治疗结果至关重要.
- 在这种特定人群中,对元基因组下一代测序 (mNGS) 的应用存在有限的证据.
研究的目的:
- 评估mNGS的诊断性能与常规微生物学测试 (CMT) 相比,用于识别ECMO支持的肺炎新生儿的病原体.
- 评估mNGS在指导治疗决策和改善患者预后方面的临床实用性.
主要方法:
- 对电子医疗记录进行了回顾性分析.
- 来自ECMO治疗肺部感染的新生儿的支气管支气管洗液样本使用mNGS和CMT进行了分析.
- 包括从2021年7月到2023年1月的数据.
主要成果:
- 大基因组下一代测序 (mNGS) 在77.8%的病例中检测到病原体,明显高于传统微生物学测试 (CMT) 的44.4%检测率.
- 克莱布西拉肺炎菌,阿辛托巴克特宝曼尼菌和大肠杆菌是最常见的病原体.
- 基于mNGS结果的治疗调整导致所有经历了这种变化的9名儿童的症状缓解.
结论:
- 甲基因组下一代测序 (mNGS) 与ECMO上的肺炎新生儿的常规微生物学测试 (CMT) 相比,显示出更高的灵敏度和更早的病原体检测.
- 在这种高风险新生儿群体中,mNGS对病原体识别和优化抗生素治疗具有显著的潜力.
