在鱼类产品中存在的微生物种群和抗体的分析和来源追踪
Xiran Li1, Hongye Wang1, Hisham Abdelrahman2
1Department of Food Science and Technology, University of California Davis, Davis, CA 95616, United States.
International journal of food microbiology
|February 2, 2024
概括
加工环境对鱼类微生物群和抗生素耐药性基因 (ARG) 有重大影响. 该研究发现,加工环境对片微生物有很大贡献,并确定了在片上丰富的特定ARG,突出了对AMR缓解策略的需求.
科学领域:
- 食品微生物学 食品微生物学
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
- 环境微生物学 环境微生物学
背景情况:
- 食品加工环境中的微生物会影响食品的质量和安全,并可能含有抗生素耐药基因 (ARG).
- 鱼类加工厂的微生物生态及其在抗菌素耐药性 (AMR) 传播中的潜在作用受到研究不足.
- 了解这些设施中的微生物动态和耐药性对公共卫生至关重要.
研究的目的:
- 调查鱼加工设施的微生物组成和抗体.
- 为了确定加工环境对最终鱼片微生物群的贡献.
- 为了确定与Listeria spp.相关的特定微生物特征和ARG. 和 filet 的污染.
主要方法:
- 16S rRNA基因测序用于微生物社区分析.
- 针对抗微生物耐药性基因 (ARG) 概况的元基因组测序.
- 快速预期-最大化微生物源追踪 (FEAST) 算法.
- 线性差异分析效果大小 (LEfSe) 用于差异丰度分析.
主要成果:
- 微生物的丰富性和多样性从鱼类增加到肉片.
- 加工环境对片微生物群的贡献很大,而与食品接触的表面的影响更大.
- 确定了212个ARG;虽然多样性下降,但ARG的丰度从鱼到鱼片保持稳定.
- 在片样本中,增强了对MLS,阴离子抗菌,氨基糖化物和β-乳酸盐产生抗药性ARG.
结论:
- 加工环境深刻地塑造了最终鱼类产品上的微生物群落.
- 特定的微生物属和ARG与Listeria spp.有关. 的存在和片污染.
- 需要额外的策略来缓解鱼类加工和产品中的抗菌耐药性.
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